genomebiology.com

<mml:math xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML">
<mml:semantics> <mml:mrow> <mml:msub> <mml:mi>g</mml:mi>
<mml:mrow> <mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mo>,</mml:mo>
<mml:mi>k</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:msub>
<mml:mo>=</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mo>{</mml:mo>
<mml:mrow> <mml:mtable columnalign="left"> <mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mn>1</mml:mn>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>probe </mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mtext> is included in transcript </mml:mtext>
<mml:mi>k</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mn>0</mml:mn>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>probe </mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mtext> not included in transcript </mml:mtext>
<mml:mi>k</mml:mi>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
<mml:mtr columnalign="left"> <mml:mtd columnalign="left"> <mml:mi>α</mml:mi>
</mml:mtd>
<mml:mtd columnalign="left"> <mml:mrow> <mml:mtext>probe </mml:mtext>
<mml:mi>i</mml:mi>
<mml:mtext> partially hybridizes with transcript </mml:mtext>
<mml:mi>k</mml:mi>
<mml:mtext> </mml:mtext>
<mml:mo stretchy="false">(</mml:mo>
<mml:mtext>useful for junction probes</mml:mtext>
<mml:mo stretchy="false">)</mml:mo>
</mml:mrow>
</mml:mtd>
</mml:mtr>
</mml:mtable>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:mrow>
</mml:semantics>
</mml:math>