Data for Polysome gradient profiles Gene name KAR5 PRM2 HO SAG1 CRH1 PRY3 PRP3 PRM4 GCY1 PGM2 AQY1 UGA1 MON1 GDH1 DAL7 DAL5 ASP3 AMD2 ASP1 Strain wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 Growth Condition (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) sorbitol (+) sorbitol (-) sorbitol (+) sorbitol (-) sorbitol (+) sorbitol YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved Fraction number % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total % of Total 1 0.19 0.07 1.48 0.06 0.14 0.22 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.03 0.50 0.06 0.16 0.04 0.06 0.02 0.00 0.00 0.25 0.04 0.02 0.03 0.04 0.031 0.45 0.10 0.12 0.03 4.48 0.47 0.04 0.03 0.09 0.47 2 3.29 1.32 3.65 0.29 0.59 0.64 0.25 0.11 0.08 0.18 0.17 0.11 0.13 1.12 2.88 0.41 1.49 0.35 0.12 0.13 3.08 0.27 7.46 0.64 2.03 0.93 0.51 0.231 3.54 0.59 1.59 0.32 27.75 2.26 1.22 0.30 1.33 3.47 3 11.39 3.63 5.48 0.91 2.35 1.74 0.68 0.26 0.43 1.35 0.37 0.22 1.09 4.72 7.04 1.22 1.31 0.05 0.00 0.03 6.52 0.00 11.80 0.87 14.36 2.93 2.03 0.452 17.13 1.70 13.62 0.64 17.59 1.36 8.45 1.98 4.10 11.24 4 14.43 4.38 13.68 2.20 4.13 11.06 5.13 2.79 1.60 4.32 2.46 3.74 5.79 14.18 6.74 2.27 3.28 0.16 3.72 0.27 11.46 0.61 5.66 0.97 8.47 2.84 1.69 0.810 11.41 1.29 16.19 0.87 5.76 1.20 8.46 2.01 2.17 5.68 5 7.60 3.32 8.79 1.65 2.58 11.78 8.56 3.46 1.46 4.18 3.09 5.41 2.32 8.25 2.79 2.17 12.79 0.71 11.21 0.53 4.89 2.78 3.67 0.78 5.87 2.88 1.33 0.743 7.35 0.90 11.11 0.65 4.34 0.91 6.00 1.22 1.48 5.05 6 12.42 6.68 10.21 3.21 3.37 10.01 8.61 3.57 2.13 6.22 3.94 4.89 3.64 9.32 7.37 5.13 8.76 1.51 6.29 0.94 12.60 3.30 5.17 1.74 6.35 7.20 1.89 1.990 9.42 2.80 9.97 1.53 4.18 3.22 10.20 3.43 2.99 9.58 7 9.14 3.63 9.20 1.93 3.11 6.30 8.32 2.34 2.29 3.41 3.84 3.65 3.81 5.00 6.78 2.49 9.19 0.52 6.39 1.05 8.16 5.19 3.14 1.41 4.67 5.15 1.65 1.578 10.08 2.03 8.89 1.55 5.70 2.51 7.02 2.64 2.58 7.56 8 4.87 4.53 6.09 3.20 2.59 5.75 5.76 2.95 1.61 4.62 3.28 5.05 3.53 6.07 5.29 4.02 4.23 2.14 3.30 1.16 5.51 7.08 3.06 1.56 5.19 6.04 1.91 2.305 6.27 2.81 6.30 1.92 3.90 3.04 10.39 1.58 3.34 6.11 9 4.72 5.55 5.26 4.23 3.15 6.61 6.50 3.81 2.61 5.73 3.63 7.18 3.66 6.48 6.26 4.83 3.42 3.09 3.07 2.93 3.37 7.06 2.59 1.87 4.83 4.45 1.91 2.359 3.59 2.61 4.59 2.42 3.25 3.48 4.58 3.46 3.15 5.29 10 3.71 4.53 4.47 3.51 3.39 4.43 5.04 3.06 3.71 5.36 3.88 5.82 5.50 4.30 5.44 5.12 3.52 2.84 5.61 3.26 5.31 8.14 2.44 2.76 5.03 6.59 2.25 3.825 3.13 4.97 4.28 2.99 2.96 5.18 4.82 5.38 4.95 4.63 11 3.86 6.21 3.89 4.59 3.77 5.81 4.94 4.38 3.61 6.67 4.17 8.22 5.65 6.16 6.65 7.44 3.25 4.26 4.09 3.39 4.12 13.34 2.10 3.06 4.72 6.65 2.40 4.746 2.75 5.17 2.94 3.35 2.51 6.11 3.12 4.72 4.89 6.45 12 2.96 6.51 3.45 4.92 4.04 4.19 4.84 4.27 4.94 5.35 4.73 7.05 7.12 4.66 5.14 6.76 3.79 4.00 3.66 2.04 2.69 4.55 2.47 3.62 4.47 7.40 2.90 6.069 2.92 6.61 2.72 3.50 2.22 7.20 4.62 8.31 6.45 5.35 13 3.42 6.47 3.38 5.01 4.43 4.49 4.88 4.09 5.04 3.87 4.84 6.14 8.25 3.91 5.35 7.33 3.75 4.68 5.24 3.82 4.57 3.83 1.85 4.34 3.91 7.75 3.40 7.859 2.15 8.31 1.70 3.25 1.74 7.85 2.83 8.67 6.47 4.79 14 2.91 6.42 3.14 5.69 4.43 3.59 4.23 4.01 5.89 5.35 5.21 5.78 8.26 3.65 4.87 6.85 5.83 5.17 4.93 3.51 6.71 6.14 2.34 5.09 4.88 6.57 5.18 11.766 2.42 9.90 2.11 4.75 1.71 9.99 3.04 8.12 9.69 5.56 15 1.79 4.46 2.71 4.02 4.30 1.90 3.36 2.70 7.72 5.00 4.60 4.33 7.35 2.75 4.62 4.69 4.32 7.90 5.60 7.07 3.83 7.49 2.41 5.54 4.24 8.11 9.66 13.920 2.53 9.45 1.47 5.90 1.75 9.63 3.93 9.20 11.12 4.38 16 1.91 3.61 1.99 3.64 5.69 1.49 3.95 2.36 7.87 4.52 5.59 2.89 6.07 1.79 2.12 2.85 6.83 6.93 6.27 5.31 3.50 5.18 4.47 6.41 4.28 5.61 11.22 8.804 2.59 8.12 1.55 5.35 1.43 6.46 4.28 6.36 7.75 2.80 17 1.57 6.08 1.80 8.10 5.29 3.39 3.16 7.01 7.49 7.43 5.16 5.34 4.41 2.71 3.28 6.47 3.78 7.65 5.94 6.70 2.09 3.38 5.48 9.63 3.63 4.34 14.57 7.613 1.95 7.70 1.61 7.90 1.38 6.47 3.88 5.99 6.15 2.09 18 1.35 4.08 1.54 7.04 6.74 2.72 3.40 6.57 7.36 3.35 5.99 3.66 4.21 2.55 4.21 5.65 3.75 11.87 5.40 4.69 2.53 4.92 6.98 11.11 2.58 3.00 8.37 5.542 1.60 4.84 1.11 7.36 1.14 3.54 1.86 5.10 3.44 1.48 19 1.19 3.87 1.41 7.48 6.94 2.60 2.74 7.54 6.05 2.02 6.24 3.20 3.08 2.47 2.83 5.38 3.53 11.12 3.92 5.89 2.22 2.77 8.43 11.71 2.53 2.46 6.11 4.012 1.65 4.21 1.51 9.83 1.13 3.73 2.32 5.41 3.23 1.48 20 1.20 2.38 1.23 6.41 7.48 2.16 3.08 6.99 6.08 3.45 6.18 3.83 2.69 1.87 2.72 4.90 2.66 5.86 2.79 9.22 1.18 2.10 6.19 7.61 2.10 2.25 4.88 2.977 1.36 3.14 1.45 8.72 1.12 2.98 1.55 3.85 3.19 0.97 21 1.00 2.85 1.45 5.53 5.13 2.38 2.36 7.16 4.98 3.62 5.12 3.19 2.82 1.81 2.04 3.95 2.17 5.35 2.34 10.38 1.72 3.38 3.32 5.11 1.50 1.67 4.08 2.746 1.17 2.84 1.20 7.75 0.79 2.75 1.28 2.59 2.66 1.10 22 0.85 3.04 1.15 5.91 4.31 2.23 2.08 7.56 4.27 3.76 4.62 3.55 2.09 1.72 2.13 4.21 2.53 4.83 3.52 12.41 1.34 2.56 2.70 5.27 1.10 1.89 3.37 3.287 1.12 3.56 0.89 6.22 0.79 3.31 1.44 2.59 2.33 1.43 23 0.92 4.37 2.06 5.68 3.61 2.69 3.97 2.61 3.08 5.31 4.77 3.16 2.61 2.64 2.59 5.20 1.53 1.58 4.00 3.792 1.66 3.87 1.18 7.26 1.01 3.82 1.74 3.78 3.09 2.19 24 1.45 4.08 2.57 4.96 3.94 2.65 2.58 4.13 6.05 7.83 3.43 3.67 1.73 1.67 4.65 2.542 1.76 2.47 1.89 5.92 1.39 2.55 2.97 3.28 3.35 0.86 Ribosome loading Gene name KAR5 PRM2 HO SAG1 CRH1 PRY3 PRP3 PRM4 GCY1 PGM2 AQY1 UGA1 MON1 GDH1 DAL7 DAL5 ASP3 AMD2 ASP1 Strain wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype wildtype delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 delta gcn2 Growth Condition (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) alpha factor (+) alpha factor (-) sorbitol (+) sorbitol (-) sorbitol (+) sorbitol (-) sorbitol (+) sorbitol YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved YPD Nitrogen Starved Fraction Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading Ribosome loading 1 2 3 4 5 0.000 0.000 0.080 0.002 0.001 0.123 0.0965 0.0150 0.000 0.030 0.020 0.043 0.003 0.088 0.013 0.006 0.134 0 0.096 0 0 0.0123 0.017 0.000 0.044 0.008 0.000 0 0.0578 0.0000 0.0945 0 0.0229 0.0000 0.0433 0.0000 0.0000 0.0330 6 0.000 0.000 0.137 0.024 0.023 0.130 0.1389 0.0214 0.002 0.075 0.040 0.046 0.031 0.134 0.092 0.051 0.115 0 0.062 0 0.159 0.0279 0.060 0.000 0.076 0.092 0.0000 0.000 0.1194 0.0168 0.1253 0.000 0.0320 0.0183 0.1236 0.0290 0.0149 0.1290 7 0.170 0.041 0.169 0.009 0.022 0.101 0.1854 0.0000 0.008 0.036 0.054 0.038 0.048 0.067 0.115 0.019 0.167 0 0.087 0 0.133 0.0752 0.020 0.000 0.064 0.076 0.0000 0.000 0.1841 0.0072 0.1542 0.000 0.0813 0.0069 0.1131 0.0262 0.0101 0.1332 8 0.093 0.087 0.137 0.048 0.004 0.121 0.1409 0.0180 0.000 0.093 0.059 0.098 0.054 0.137 0.111 0.070 0.069 0 0.036 0 0.109 0.1509 0.024 0.000 0.105 0.135 0.0000 0.000 0.1361 0.0325 0.1315 0.001 0.0525 0.0288 0.2428 0.0084 0.0414 0.1313 9 0.114 0.156 0.145 0.097 0.042 0.191 0.2228 0.0668 0.029 0.168 0.088 0.212 0.076 0.196 0.182 0.120 0.053 0.0336 0.038 0.0343 0.069 0.1950 0.005 0.000 0.120 0.103 0.0000 0.000 0.0737 0.0348 0.1051 0.020 0.0416 0.0581 0.1155 0.0740 0.0451 0.1357 10 0.090 0.146 0.146 0.093 0.074 0.132 0.1789 0.0372 0.103 0.198 0.122 0.204 0.209 0.108 0.189 0.170 0.074 0.0313 0.163 0.0591 0.170 0.2924 0.000 0.015 0.165 0.258 0.0000 0.078 0.0708 0.1589 0.1182 0.054 0.0378 0.1762 0.1575 0.1754 0.1658 0.1359 11 0.121 0.306 0.144 0.180 0.128 0.261 0.2105 0.1589 0.118 0.349 0.164 0.421 0.268 0.296 0.305 0.357 0.072 0.1198 0.116 0.0803 0.147 0.6393 0.000 0.041 0.182 0.325 0.0000 0.165 0.0643 0.2096 0.0639 0.089 0.0171 0.2883 0.1024 0.1831 0.2015 0.2947 12 0.075 0.397 0.143 0.241 0.188 0.182 0.2443 0.1807 0.262 0.303 0.233 0.414 0.459 0.204 0.259 0.382 0.132 0.1273 0.113 0.0031 0.086 0.2055 0.000 0.099 0.199 0.462 0.0368 0.319 0.0911 0.3618 0.0616 0.120 0.0000 0.4500 0.2248 0.4543 0.3876 0.2661 13 0.132 0.471 0.164 0.296 0.278 0.247 0.2946 0.1940 0.321 0.202 0.284 0.406 0.666 0.150 0.324 0.507 0.155 0.2102 0.263 0.1541 0.247 0.1908 0.000 0.195 0.179 0.593 0.1001 0.574 0.0405 0.5834 0.0000 0.121 0.0000 0.6111 0.1264 0.5730 0.4676 0.2629 14 0.099 0.550 0.169 0.416 0.327 0.186 0.2517 0.2183 0.482 0.427 0.367 0.437 0.783 0.139 0.332 0.550 0.424 0.2959 0.281 0.1511 0.484 0.4351 0.000 0.324 0.335 0.551 0.3542 1.176 0.0763 0.8569 0.0224 0.303 0.0239 0.9995 0.1699 0.6277 0.9704 0.4034 15 0.000 0.362 0.146 0.299 0.353 0.000 0.1447 0.0338 0.819 0.453 0.363 0.320 0.771 0.009 0.355 0.383 0.290 0.6604 0.403 0.5915 0.260 0.6469 0.000 0.446 0.297 0.875 1.1081 1.695 0.1027 0.9478 0.0000 0.497 0.0000 1.1151 0.2973 0.8504 1.3527 0.3065 16 0.000 0.272 0.073 0.292 0.727 0.000 0.2841 0.0000 0.977 0.438 0.537 0.140 0.678 0.000 0.071 0.179 0.733 0.6392 0.558 0.4492 0.262 0.4684 0.412 0.665 0.350 0.582 1.5624 1.084 0.1286 0.9100 0.0000 0.496 0.0000 0.7367 0.3898 0.6331 0.9739 0.0974 17 0.000 0.797 0.053 1.024 0.726 0.255 0.1460 1.0206 1.041 1.088 0.555 0.607 0.449 0.001 0.261 0.799 0.291 0.8460 0.590 0.7336 0.104 0.2845 0.715 1.391 0.274 0.415 2.4831 1.009 0.0414 0.9758 0.0000 0.991 0.0000 0.8485 0.3884 0.6732 0.7960 0.0000 18 0.000 0.466 0.015 0.987 1.247 0.152 0.2272 1.0568 1.153 0.310 0.754 0.346 0.465 0.000 0.460 0.763 0.327 1.7139 0.584 0.4804 0.189 0.5690 1.226 1.912 0.074 0.170 1.3758 0.684 0.0000 0.5823 0.0000 1.028 0.0000 0.2949 0.1025 0.6236 0.2836 0.0000 19 0.000 0.472 0.000 1.202 1.485 0.142 0.0678 1.4767 0.987 0.005 0.899 0.282 0.245 0.000 0.245 0.804 0.318 1.7818 0.371 0.7827 0.156 0.2556 1.836 2.313 0.071 0.054 0.9570 0.384 0.0000 0.5254 0.0000 1.688 0.0000 0.3832 0.2033 0.7623 0.2665 0.0000 20 0.000 0.107 0.000 1.107 1.850 0.044 0.1833 1.4731 1.105 0.422 0.986 0.482 0.164 0.000 0.250 0.786 0.129 0.8245 0.170 1.6285 0.000 0.1515 1.282 1.442 0.000 -0.001 0.7087 0.136 0.0000 0.3387 0.0000 1.631 0.0000 0.2136 0.0639 0.5355 0.2901 0.0000 21 0.000 0.270 0.000 1.028 1.095 0.114 0.0000 1.7267 0.906 0.532 0.880 0.354 0.223 0.000 0.109 0.633 -0.001 0.7968 0.083 2.1240 0.084 0.4547 0.320 0.823 0.000 0.000 0.5243 0.078 0.0000 0.3003 0.0000 1.564 0.0000 0.1618 0.0081 0.3070 0.1491 0.0000 22 0.000 0.368 0.000 1.246 0.830 0.076 0.0000 2.0777 0.760 0.638 0.852 0.510 0.000 0.000 0.145 0.777 0.118 0.7385 0.410 2.9247 0.000 0.3016 0.086 0.972 0.000 0.000 0.3203 0.279 0.0000 0.5432 0.0000 1.283 0.0000 0.3819 0.0501 0.3414 0.0472 0.0000 23 0.000 0.903 0.000 0.000 0.0000 1.4464 0.591 0.280 0.828 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.327 0.9658 0.828 0.3604 0.344 0.3526 0.043 1.047 0.000 0.000 0.6153 0.507 0.0000 0.7015 0.0000 1.762 0.0000 0.6274 0.1434 0.7138 0.3582 0.0000 24 0.000 0.939 0.0000 1.2945 0.000 0.000 0.949 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.162 0.6667 1.333 2.0002 0.000 0.0000 0.000 0.498 0.000 0.000 0.9706 0.018 0.0000 0.2730 0.0000 1.455 0.0000 0.1308 0.0000 0.6320 0.5058 0.0000